Organami NASK są:
- Dyrektor,
- Rada Naukowa.
Dyrektor kieruje NASK, a w szczególności:
- ustala plany działalności,
- realizuje politykę kadrową,
- zarządza mieniem i odpowiada za wyniki działalności NASK,
- reprezentuje NASK,
- podejmuje decyzje we wszystkich sprawach dotyczących NASK, z wyjątkiem należących do zakresu działania Rady Naukowej.
Dyrektorem NASK jest prof. Jacek Leśkow. Funkcje zastępców Dyrektora pełnią prof. dr hab. inż. Ewa Niewiadomska-Szynkiewicz (Dyrektor ds. Naukowych), Krzysztof Silicki (Zastępca Dyrektora ds. Cyberbezpieczeństwa i Innowacji) oraz Bartłomiej Klinger (Zastępca Dyrektora ds. Projektów Administracyjno-Edukacyjnych) .
Rada Naukowa
Rada Naukowa jest organem stanowiącym, inicjującym, opiniodawczym i doradczym NASK, w zakresie jej działalności statutowej oraz w sprawach rozwoju kadry naukowej i badawczo-technicznej. Kompetencje Rady Naukowej określają przepisy ustawy z dnia 30 kwietnia 2010 r. o instytutach badawczych oraz Statut NASK.
Skład Rady Naukowej
Przewodniczący Rady Naukowej
prof. dr hab. inż. Jerzy Brzeziński
Politechnika Poznańska
Wiceprzewodniczący Rady Naukowej
prof. dr hab. inż. Andrzej Dąbrowski
Politechnika Warszawska
prof. dr hab. inż. Marek Amanowicz
NASK
Sekretarz Rady Naukowej
dr Agnieszka Wrońska
NASK
prof. dr hab. Jan Łaszczyk
Akademia Pedagogiki Specjalnej
dr inż. Jerzy Żurek
Instytut Łączności
Maciej Wyszoczarski
powołany przez Ministra Cyfryzacji
Krzysztof Dyki
powołany przez Ministra Cyfryzacji
prof. dr hab. inż. Andrzej Pacut
NASK
prof. dr hab. inż. Ewa Niewiadomska-Szynkiewicz
NASK
dr inż. Michał Karpowicz
NASK
dr inż. Adam Kozakiewicz
NASK
Marcin Bochenek
NASK